در عصر مرجعیت حاج آقا حسین قمى رحمه الله جمعى از مردم ایران اموال زیادى جهت تعمیرات آستانه سید محمد ارسال داشتند و به خصوص بین سالهاى
1308 تا 1384 هجرى قمرى این آستانه به شکل باشکوهى تکامل یافت. عمارت جدید داراى صحن مربع شکل به ضلع 150 متر است و در وسط صحن شریف حرم مطهر واقع است که گنبد کاشىکارى آن نظر هر بیننده را به خود جلب مىدارد.
محیط گنبد حدود 50 متر و ارتفاع آن 45 متر است و در کنار آن منارهاى به ارتفاع 40 متر در سال 1379 قمرى برافراشتهاند. در مقابل حرم یک ایوان مسقف با ستونهاى باشکوه خودنمایى مىکند.
حرم مطهر با کاشىکارى و آیینهکارى هنرمندان ایرانى مزین شده و آیتى از هنر اسلامى را منعکس مىکند. قبر مطهر در وسط حرم واقع است و بر روى آن صندوق نفیس و ضریح نقره نصب است.(1)
1) منابع: اعیان الشیعة: ج 2، ص 37، و ج 10، ص 5. تاریخ سامرا: ج 1، ص 235، دائرةالمعارف الاسلامیة الشیعیة: ج 31 ص 10.
